下设站前所、站后所、计划经营部、总承包部、办公室和人事财务部六个部门，目前已能独立完成铁路专用线及穿跨越项目的勘察、设计和总承包工作，具备了一定的独立生产能力。乌鲁木齐分院自成立以来，先后承担了中石油北屯成品油库铁路专用线、浙能新疆阿克苏能源开发有限公司纺织工业城热电厂铁路专用线、乌鲁木齐铁路局乌西国际物流基地建设工程项目、“十二五”铁路军用设施塔什店车站建设项目、“十二五”铁路军用设施乌苏车站建设项目、新疆东方希望有色金属有限公司准东铁路专用线等项目的勘察设计。乌鲁木齐分院坚持以人为本，致力于提升自主创新能力，诚信经营，着眼于为政府、行业和企业提供优质的服务。